遗传因素自闭症康复机构图册双生子研究显示，自闭症康复机构在单卵双生子中的共患病率高达61%到90%，异卵双生子则未见明显的共患病情况。兄弟姊妹之间的再患病率，估计在百分之4.5左右。这些现象的提示孤独症存在遗传倾向性。
自闭症康复机构研究显示，某些染色体异常可能会导致孤独症的发生。已知的相关染色体有7q、22q13、2q37、18q、Xp；某些性染色体异常也会出现孤独症的表现。47、XYY以及45、X/46、XY嵌合体等。较常见的表现出孤独症症状的染色体病有4种：脆性X染色体综合征、结节性硬化症和15q双倍体和苯丙酮尿症。
自闭症康复机构感染与免疫因素早在20世纪70年代末就有研究发现，孕妇患病毒感染后，其子代患孤独症的机率的增大。后来数个研究均提示，孕期感染和孤独症发生可能有一定的关系。目前已知的相关病原体有：风疹病毒、巨细胞病毒、水痘——带状疱疹病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体和弓形虫等。这些病原体产生的抗体，由胎盘进入胎儿体内，胎儿正在发育的神经系统发生交叉免疫反应，干扰了神经系统正常发育，导致了孤独症的发生。
自闭症康复机构孕期理化因子刺激，受孕早期的孕妇若有反应停和丙戊酸盐类抗癫痫类药物的用药史和酗酒等，导致子代患孤独症的机率增加。对怀孕12.5d的大鼠一次性高剂量腹腔注射的丙戊酸钠，其子代鼠表现出类似孤独症的行为学表现。还有研究发现，孕期大鼠暴露于反复冷冻刺激中，也会增加子代患孤独症机率；对孕鼠进行反复冷冻刺激，其子代也表现出孤独症的行为学特征。
自闭症康复机构研究显示，某些染色体异常可能会导致孤独症的发生。已知的相关染色体有7q、22q13、2q37、18q、Xp；某些性染色体异常也会出现孤独症的表现。47、XYY以及45、X/46、XY嵌合体等。较常见的表现出孤独症症状的染色体病有4种：脆性X染色体综合征、结节性硬化症和15q双倍体和苯丙酮尿症。
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